对于染色体异常的夫妇，要根据染色体异常的具体类型、哪条染色体有问题以及问题的类型，决定助孕方式。多数具有染色体异常问题的人能做试管婴儿，但前提是染色体异常的问题并未导致缺少精子或者卵子，能够取到女方卵子和男方精子时，一般能够进行试管婴儿。
为了避免后代出现同样染色体异常问题，建议进行三代试管婴儿，即对实验室培养的胚胎进行遗传学筛查，把染色体异常胚胎挑选出去，把染色体正常胚胎保留下来，利用染色体正常的胚胎进行胚胎移植，可以避免父亲或者母亲的染色体问题遗传给自己的下一代，也有利于下一代的健康。但是部分夫妻的染色体问题会导致取不到卵子或者精子，此时则无法进行试管助孕。
