眼睛红有黄脓眼屎，使用的药物常见有以下几种：

1、抗菌药物：眼睛红有黄脓眼屎提示可能患有细菌性结膜炎，可以使用妥布霉素滴眼液、加替沙星滴眼液、氧氟沙星滴眼液、左氧氟沙星滴眼液，这类普通的抗菌素眼药水，在其中选用一种。当分泌物比较多时，在早期可以进行大剂量的滴眼。当3天治疗无效的时候，通常要更换另外一种抗菌素眼药水，强效的抗菌素眼药水，比如夫西地酸滴眼液。在睡觉前通常要使用一些眼药膏以维持眼表的有效抗菌素的药物浓度，比如左氧氟沙星眼用凝胶；

2、抗病毒药物：当眼睛红有黄脓眼屎，还要注意合并有病毒感染。因为病毒感染和细菌感染可以同时存在，由于病毒感染表现的是水样分泌物，和黄脓眼屎的细菌感染，有时无法分清。因此可能会加用更昔洛韦眼用凝胶，抗病毒药物滴眼；

3、非甾体类消炎药：除了抗菌、抗病毒治疗以外，还可以使用一些非甾体类消炎药，以缓解眼表症状，比如结膜充血和疼痛，包括普拉洛芬滴眼液、色甘酸钠滴眼液；

4、眼表修复剂：比如碱性成纤维细胞生长因子滴眼液、表皮细胞生长因子滴眼液。

当眼睛红以及眼屎比较多时，建议患者应尽快到医院就诊。