肝脓肿鉴别诊断，在病原菌方面主要区别细菌性和阿米巴性脓肿，另外有些右肝的脓肿比较靠近右膈下，要跟右膈下脓肿区别。如果是右膈下脓肿，详细的B超或者CT检查可以区别出来。
另外一个就是肝内胆管结石并感染的鉴别，这方面比较难，因为胆管结石并感染的患者本身也是引起肝脓肿的一个病因，大部分患者扩张的胆管感染，跟肝脓肿的表现有时比较难以区别，详细的CT或者B超检查是必要的。
另外一个就是伴有高热的原发性肝癌，特别是肝癌，巨大的肝癌里面并有一些癌细胞坏死，癌性发热因子释放的时候，第一方面肝脏有占位，里面有液化，
另外又表现出一个明显的高热状态，这个方面就比较难鉴别，一般通过有没有肝炎或者引起肝癌的相关因素，肝癌AFP相关指标升高，肝脏肿物的包膜表现来做一个鉴别。
