幽门螺杆菌感染应该没有自愈性。因为幽门螺杆菌菌从婴儿出生，一般出生不久可能在胃内存在，而随着年龄增长，胃内有幽门螺杆菌的机会就越来越大，更像是后天的感染性问题。胃内有菌如果不根除，而让它自我消灭，一般几率不高，只有一些特别情况，由于其它疾病存在，可能要用比较多的广谱抗菌素。在使用这些药物过程中，实际上间接就把胃中细菌也做了清除，是否能达到根除目的还不清楚。但既然使用抗菌素，就有可能是顺带着把它兼顾，实际上不是积极主动的根除菌。但这种因为不是现在国际、国内共识和推荐的治疗组方，是否能够达到一生中的真正根除不好定论。理论上如果要是使用抗菌素，有可能顺带的造成菌在体内的消灭。
