眼角膜肿了，实际上由于眼角膜的内皮细胞功能受到损伤，且损伤较明显，内皮细胞无法进行自身的代偿修复。内皮细胞通常无法进行自我增殖，修复完全靠内皮细胞的扩大，即内皮细胞变肿、变大来修复缺损面积，甚至出现内皮细胞移行，即部分正常的内皮细胞从健康的部位或周边的部位，移动到缺损的部位。内皮细胞发生肿胀、角膜变种常见于内皮细胞的功能受损，同时也可见于上皮细胞屏障功能的损伤。
这二者的损伤在临床上常见于青光眼，或泪眼手术以后内皮细胞的大量损失以及角膜炎等上皮屏障功能的损伤，造成感染。角膜之所以会发生水肿，是由于角膜透明性的三要素发生变化。第一是上皮细胞屏障功能的损伤，第二是内皮细胞泵功能的损伤，内皮细胞上有钠钾离子泵，可使角膜组织中多余的水分排到角膜外即排到前房里，维持角膜透明性。第三是内皮细胞大量丢失，钠钾泵则无法进行正常的工作。
