如果术前能够非常明确的判断仅是囊肿，即为良性疾病，一般是采取单纯的囊肿切除或纵隔肿物切除方式。纵隔肿瘤因为涉及到肿瘤，就必然要涉及到肿瘤的细胞类型、肿瘤是否有外侵，医生会根据肿瘤的病理类型、有无外侵来初步判断临床分期，确定是属于早期、中期还是晚期。
分期不同，切除范围和治疗方法会有不同。如果是早期或中早期的肿瘤，会做微创手术；对于晚期或恶性程度非常高的肿瘤，会在获得明确病理诊断的前提下，给予放疗、化疗等保守治疗。总而言之，纵隔囊肿是良性病，单纯手术切除即可。而对于纵隔肿瘤，需要根据不同的分期进行相应的治疗。
