扁桃体发炎细菌、病毒感染都有，早期时多半是病毒感染造成，但是病毒感染多数都会继发细菌感染，尤其亚洲人比较常见，因为本身由于基因或者由于饮食习惯或生活习惯，可能锻炼平时少，亚洲人种在免疫力方面有时不如西方人免疫力强。但可能平时通过经常锻炼，饮食结构调整，也可以达到免疫力很好的情况，在免疫力很好时，病毒感染可以自愈，不用吃抗生素即可。
但一旦出现了急性化脓性扁桃体炎、细菌感染时，还要尽早给予抗生素治疗，这时需要找大夫诊断到底是细菌还是病毒感染引起。因为如果要是细菌感染，不给予抗生素治疗，病程进展会很快，有时可能会引起很严重的扁桃体周围炎、扁桃体周围脓肿，会造成很严重的问题。
