胚胎型大脑后动脉是临床影像学的检查结果，说明患者大脑后动脉未完全发育成正常成人，可能会引起脑供血不足。发现胚胎型大脑后动脉后，需根据患者情况具体分析，如果患者无明显临床症状，通常无需进行相应治疗，需要随诊，通常定期复查头颅血管核磁或超声进行先后对比。如果患者出现头晕或其他脑缺血症状，经过临床医师分析，认为与胚胎型大脑后动脉相关，根据医生嘱托应用药物治疗缓解症状。
大多情况下胚胎型大脑后动脉会干扰血流，引起动脉瘤行程或末端血管的缺血症状，如头晕、视力障碍、视物模糊、肢体麻木、无力、癫痫等症状，需积极进行治疗，包括内科治疗和外科手术治疗。内科药物为改善血液循环、脑保护、预防脑梗的进一步发展，外科开颅手术主要通过外科直接将动脉瘤夹闭，或用弹簧圈栓塞基底动脉尖动脉瘤的方式进行治疗。
