咖啡对胃病有影响，多数人在喝咖啡后可能产生兴奋作用，因为咖啡会影响到神经功能，当交感和副交感神经失去平衡后，可能会影响到胃酸分泌。另外也会影响到胃部动力，咖啡因容易刺激胃部，使得胃酸分泌增加。
当空腹饮用咖啡后，可能会感觉到胃内不适，若患有胃病如胃炎、糜烂、溃疡时，又空腹饮用咖啡，会导致胃酸分泌增加，使胃炎症状增加、加重，会产生胃胀、胃部不适、胃疼，甚至反酸、烧心等症状。
饮用咖啡也会影响神经功能，部分人群饮用咖啡后，可能影响到睡眠。当睡眠不佳可能会出现神经功能紊乱，此后影响到胃肠动力，可能会出现胃胀、肠道蠕动过快，甚至胃部敏感人群，可能会出现肠道动力过快，从而产生腹泻等症状。
也有部分人群把饮用咖啡作为促进排便妙招，若患有便秘，可能饮用咖啡后，对排便具有促进作用。若本身排便次数多，或容易腹泻的人群。一般建议少饮用咖啡，或饮用淡咖啡。
