儿童手足口病的诊断，临床主要通过以下几个方面确诊：
1、临床症状：通常手足口病的儿童，会出现发热，通常是高热，39℃左右的发热。同时伴随有食欲的下降、乏力、精神会发蔫、不爱玩耍等。另外，儿童会出现口腔、身体、手足的症状，即在手心、脚心、臀部，会出现疱疹样的皮疹，身体上有时候也会出现一些斑丘疹。躯干的皮肤上最典型的是在口腔的咽峡部出现疱疹，所以儿童会出现吞咽非常困难，进食、进水都非常疼痛，继而导致食欲明显受到影响。
2、咽拭子来检测：也可以通过咽拭子来检测，引起手足口病的病毒核酸的检测，如果是阳性，通常提示儿童有手足口病；
3、大便培养：也可以通过大便的培养，来检查是否存在柯萨奇病毒，或者是EV71肠道病毒的阳性，如果培养到了这个病毒，就可以确诊。
