尿液中非鳞状上皮细胞增高，说明存在肾小管上皮细胞或者移行上皮细胞升高的可能。尿液中的上皮细胞分为三种类型，包括肾小管上皮细胞、移行上皮细胞和复层扁平上皮细胞，其中复层扁平上皮细胞，即鳞状上皮细胞。如果是非鳞状上皮细胞增高，存在有肾小管上皮细胞和移行上皮细胞升高，这两种上皮细胞升高的临床意义不尽相同。
肾小管上皮细胞升高，主要是肾小管病变，因为肾小管上皮细胞主要来源于肾小管，有时候在肾移植术后，要监测肾小管上皮细胞，明确是否存在排斥反应。移行上皮细胞共分为三层，表层移行上皮细胞来源于膀胱，中层移行上皮细胞来源于肾盂，而底层移行上皮细胞来源于输尿管、膀胱和尿道。正常情况下，尿液中没有或者偶尔可以见到移行上皮细胞，如果存在于尿液中，提示尿路感染，如果大量出现，要警惕移行上皮癌的可能。
