理论上机体各个器官和部位都可能产生囊肿，比如头部可以产生囊肿，肝部、肾脏以及女性卵巢等部位都可能产生囊肿，不同部位的囊肿有不同的处理办法。大部分囊肿是良性病变，如果局部有压迫症状，或者囊肿增大很明显才需要手术，单纯的一个小囊肿，无论在哪个器官多半都不需要手术治疗。
女性常见的囊肿是卵巢囊肿和宫颈囊肿，宫颈囊肿也称为宫颈纳氏囊肿，是慢性宫颈炎的表现。首先要检查宫颈TCT和HPV，以除外宫颈癌前病变甚至宫颈癌。除外严重情况之后，宫颈纳氏囊肿一般没有临床症状不需要特殊治疗。女性另一种常见的囊肿是卵巢囊肿，卵巢囊肿大部分属于生理性卵巢囊肿，是卵巢黄体或者滤泡持续存在的表现。一般囊肿直径<3-4cm，也不需要治疗，来1-2次月经之后就会自行消退。一部分卵巢囊肿属于卵巢肿瘤性疾病，比如卵巢巧克力囊肿、卵巢浆液性囊腺瘤、卵巢粘液性囊腺瘤等，一般需要行手术摘除。
