后脑一跳一跳的疼原因及治疗如下：
1、偏头痛：首先要考虑是一种原发性的头痛，即偏头痛的发作。偏头痛发作和劳累、女性生理期、情绪波动有关，这些情况容易诱发，表现为一跳一跳的搏动性跳痛，还会伴有恶心、呕吐、畏声、畏光，需要给予氟桂利嗪改善症状；
2、枕神经痛：病毒感染可以引起的枕神经痛，枕神经位置神经结容易潜伏病毒，劳累、免疫力下降的时候，容易出现神经病毒复制，出现神经痛的症状。表现为一跳一跳的刺痛，还会有灼烧样的感觉，比较严重的患者，会出现刀割样和撕裂样的疼痛。需要给予加巴喷丁、普瑞巴林胶囊、卡马西平、奥卡西平。针对神经痛的对症治疗，还要给予营养神经的药物，如甲钴胺、维生素B1注射液，可以改善枕神经痛；
3、颞动脉发炎：也会引起一跳一跳的痛，需要给予激素和抗生素治疗颞动脉炎；
4、颅内压增高：这种情况下要做颅内检查，查看是否存在脑积水、脑炎；
5、高血压：要控制好血压来改善症状。
