自身免疫性甲状腺炎这一类疾病最终都会引起甲状腺功能减退，实际免疫功能紊乱针对抗体阳性没有特别好的治疗方案，用药都是基于出现甲状腺功能异常，比如甲亢、桥本氏甲状腺炎早期，因为有甲状腺自身免疫破坏，会出现破坏性甲状腺毒症表现，特别是对于TSH刺激性抗体阳性者，甲亢期较长，可以用抗甲药物治疗。最终均会发展为甲减，在亚临床甲减TSH大于10mIU/L 的时候，可以用左甲状腺素钠片干预，把TSH降到1.5mIU/L 左右，这样抗体滴度会有所下降，治疗主要是针对甲状腺功能异常。除针对甲状腺功能异常用一些药物之外，还可以考虑中医药调节免疫治疗，或者补充一些微量元素硒之类，对于自身免疫也许有所获益。
