脚气和灰指甲均是由于皮肤癣菌等致病真菌感染所引起，在治疗原则上相同，均是使用抗真菌药物治疗，所以可以同时治。脚气是由皮肤癣菌感染脚部皮肤所引起的一种真菌病，灰指甲也称甲癣，是由致病真菌感染甲板所引起的病变。在治疗原则上两者均是外用或内服抗真菌药物治疗，一般内服抗真菌药物，比如伊曲康唑、特比萘芬，对于脚气和灰指甲可以同时起效。但对于灰指甲而言，所需要的疗程更长，一般在灰指甲还没有完全治愈时，脚气可能已经被彻底治愈。
脚气和灰指甲部位使用的外用药通常有区别，脚气通常使用一般的抗菌药膏，如达克宁乳膏、美克等，而灰指甲要使用渗透力比较强的药物，如阿莫罗芬搽剂等才能起到效果。建议脚气和灰指甲同时治疗，因为如果只治疗其中一种，比如灰指甲治好愈，脚气没治愈，脚气可以逐渐蔓延导致灰指甲复发。相反如果局部的灰指甲没有治育，只治好愈脚气，灰指甲中的真菌也有可能蔓延到脚部皮肤引起脚气复发。
