先天性肥厚性幽门狭窄一般在诊断明确情况下，就可以及时安排手术。先天性肥厚性幽门狭窄会对患儿身体造成营养不良等影响，会影响患儿发育，所以诊断清楚情况下，应及时手术。但是术前要做相应术前准备，因为肥厚性幽门狭窄患儿会出现营养不良、电解质紊乱等一系列表现，所以在术前可以适当地纠正内环境，改善营养情况，为手术创造一个比较良好的条件。先天肥厚性幽门狭窄手术方式采取的是幽门环肌切开术，把肥厚的幽门肌层切开，然后让幽门黏膜往外面膨露，同时幽门管管腔扩大，这样有利于胃内容物下行，解除梗阻。目前来讲肥厚性幽门狭窄的治疗方案很成熟，治疗效果也比较确切，所以一旦患儿家长发现患儿类似于剧烈频繁呕吐症状，高度怀疑肥厚性幽门狭窄疾病情况下，请及时到医院就诊。
