凡有上消化道症状的患者，经过各种检查未能确诊，原因不明的上消化道出血，食管及胃内肿物的取出、息肉的切除等，都需做食道镜下活检。食道做活检时会带来一些危害：
1、造成吸入性肺炎：由于吸入唾液或者胃镜头端误入气管，或由于局麻外伤，产生轻度的暂时的咽部运动功能失调；
2、出血：黏膜损伤撕裂或插镜后反复剧烈呕吐，可导致出血。故操作过程中动作要轻柔，误用暴力，防止插伤出血，同时活检时应避开大血管；
3、穿孔：食管穿孔是最严重的并发症，但很少见，多为进镜时用力过猛，或企图盲目进入食管导致的，可引起胸痛、纵隔及皮下气肿、气胸及胸水、气管瘘等；
4、心血管意外：对高血压患者进行食管镜检查的时候，应严格掌握指征，必须实行心电监护，一旦出现症状要及时抢救。
