乳腺纤维腺瘤治疗手段首选方式是手术切除，手术切除可选择直接手术切除，从皮肤切口将肿块挖出，其优势在于能完整将包膜一并切除，但显而易见，皮肤上存在伤口，虽然伤口并不大，常规在2cm左右。还有一种方式是进行微创旋切手术，在肿块下方插入存在负压吸引的旋切刀，将肿块逐渐进行旋切。其优点在于伤口很小，即1cm左右的伤口，甚至无需缝合，直接贴创可贴即可。因为是在B超下通过旋切刀旋切，可能对于部分患者切除并不彻底，会有部分残留，从而导致增加术后复发风险，或B超上观察到存在残留病灶。
乳腺纤维腺瘤若是良性，即使存在残留，也无需过分担心。另外，需要关注是否需要进行手术。对于小于1cm的肿块而言，如果发生在边缘，从检查考虑纤维腺瘤，则需要定期随访复查，如半年左右复查一次；如果是大于2cm或发生于乳头后方的肿块，才可考虑手术介入，可进行手术切除。
