目前肛裂没有什么特效药，肛裂通俗来说的话可分成两期。第一早期肛裂或者新鲜肛裂。肛裂刚刚发生，创面组织都比较新鲜，没有形成疤痕、溃疡，没有肛裂三联征、五联征，可以通过药物或者是坐浴、熏洗来达到治愈的目的，常用的药物跟痔疮差不多，出血可用些止血的药物，如地奥司明片、裸花紫珠；疼痛可以用一些止疼的药物。坐浴、熏洗对新鲜的肛裂治愈效果比较好，通过坐浴、熏洗改善局部的血液循环，药物直接到了创面，保持局部清洁，促进伤口的修复。第二陈旧性的肛裂，或就是出现了明显的溃疡、疤痕、肛裂三联征、五联征，则需要通过手术解决。临床上也有报道说硝酸盐或肉毒素的注射也有治疗效果，但效果据观察没有直接做手术快、治愈率高。
