深部胶质瘤、脑胶质瘤、颅内肿瘤的发病原因比较复杂，没有一个明确的结论，大部分是因为遗传的易感因素和一些环境因素相结合造成。一些影响因素，比如神经纤维瘤病Ⅰ型，还有结节性硬化症，跟脑胶质瘤的发生有明显的关系。环境因素，像电磁辐射，熟悉的手机信号辐射可能跟胶质瘤有关系，但是没有明确的相关性。其他的一些化学因素，像一些特殊的化学试剂引起脑胶质瘤的可能性都有，但也不是有明确的相关关系。另外还有一种就是跟病毒感染相关，因为巨细胞病毒比较多见，脑胶质瘤的病理组织里头可以发现巨细胞病毒，但是这个病毒和脑胶质瘤发生是不是直接相关，也没有明确的证据。
