单纯性肠炎引起的腹泻可使用蒙脱石散等止泻药物对症治疗。病毒或细菌感染引起的腹泻主要以对因治疗为主，细菌感染应给予抗生素治疗，病毒感染应给予抗病毒治疗。无头孢抗生素过敏史者，可用头孢氨苄等头孢三类治疗细菌感染，儿童与年长者一般不使用喹诺酮类抗生素；病毒感染常用病毒唑、利巴韦林、阿昔洛韦等药物进行抗病毒治疗。