怀孕六周既可以做人工流产，也可以实行药物流产。人工流产即应用负压吸引置到宫腔内将胚胎或者蜕膜吸引出来，好处就是比较彻底，流血量也比较少。但也有不良反应，比如感染、子宫穿孔、宫腔或者子宫颈粘连。
而药物流产比较方便，对病人的损伤也比较小，主要是通过干扰体内雌、孕激素的变化，抑制胚胎生长。药物流产也有不好的作用，有可能引起不全流产，需要再次清宫。
两个办法都可以选择，对于怀孕六周想终止怀孕的患者，流产后应于两周后开始复查血HCG，检查HCG下降的情况。如果HCG下降的情况比较好，则认为流产手术做得比较成功、比较彻底；如果HCG水平增高，也有可能存在残留，则需要密切复查或者进一步治疗。流产后一个月应复查超声，以了解卵巢或者子宫的恢复情况。
