一般情况下，支气管灌洗比较安全。一般需完善术前准备，告知患者及其家属支气管肺泡灌洗的适应症、禁忌症以及并发症，争得患者或家属的配合，部分支气管肺泡灌洗的并发症可以避免。支气管肺泡咳嗽常见的并发症主要包括支气管痉挛、支气管出血、麻醉药物过敏、发热、气胸以及频繁咳嗽等并发症，多数均为一过性的并发症，症状一般可以得到控制和缓解。