扁桃体结石的病人会常有口腔异味、口臭，或者咽部异物感、嗓子刮磨感，这种情况轻度可以用漱口或者含片、喷剂等办法，比如可以用专用的漱口水口泰含漱液，或者用3%的双氧水进行稀释，稀释完之后可以漱口。
扁桃体的结石可能会并发厌氧菌的感染，口臭会更明显，也可以进行雾化吸入的治疗，或者用含片、喷剂等。另外，需避免诱因，如抽烟、喝酒、进食刺激的食物，避免着凉、感冒，如果以上方法都不能减少口臭或者口腔异味，则需要进行手术治疗，将扁桃体切除。
如果扁桃体结石长的频率不快，或者症状不严重，也可以用扁桃体隐窝口灌洗的方法，或者定期到医院清理扁桃体隐窝口的结石，对于缓解口臭有一定的帮助。
