CT对于脊索瘤的诊断有一定帮助，但是并不能全面、完全的确诊为脊索瘤，还要结合患者的临床表现、CT表征和核磁共振检查。如果患者条件允许，有病理支持会更好。
脊索瘤通常起自于胚胎发育时期的残存胚胎组织，好发于颅底斜坡或骶尾椎部分，对周围骨质有破坏，所以CT在诊断骨质破坏中具有一定优势。可是对于组织肿瘤的观察，因为肿瘤属于软组织类，CT并不占优势，应选择核磁共振检查。
所以，对于此类比较复杂或恶性程度比较高的疾病，临床医生通常建议患者进行多种影像学手段检查，充分分析该类疾病的生长情况，以及对周围骨质和组织结构破坏情况做全面分析，为后期手术制定方案提供有力的支持。
