动脉粥样硬化发生在全身各处主动脉及其各分支，皆可以发生。但是主要引起症状的位置是心脏、脑、肾脏和下肢，多见于心肌梗死、冠心病，和脑血管的脑梗死、脑卒中，包括肾动脉狭窄、下肢动脉硬化闭塞症。

临床发生最多、危害最大、发生率最高、最重的地方，主要是冠状动脉、颈动脉，或者颅内的动脉分支、肾动脉狭窄，以及下肢动脉硬化闭塞症等位置。上述常见部位，功能较为重要。

上述部位，一旦出现动脉粥样硬化严重狭窄、闭塞之后，通常可有致死或致残的后果。器官重要程度，也与发生频率有关。

越重要的器官，发生动脉粥样硬化引起严重后果的可能性越大。最常见的是冠状动脉狭窄、冠心病、脑血管狭窄引起的卒中，比如颈动脉狭窄、大脑前动脉、中动脉、后动脉引起的脑梗。

下肢动脉硬化闭塞症，引起早期的畏寒发凉，逐渐出现间歇性跛行，走走停停，休息一会又能走，再出现静息痛，不走路也痛，夜里睡觉无法入睡。需要坐起才能缓解，最后出现坏疽，发青、发黑、紫绀，最后坏死。

还有稍少见的，即肾动脉狭窄。因为通常没有症状，但可以引起顽固高血压、恶性高血压和肾功能不全。