益生菌可以治疗肠炎。益生菌在医院能开取出来的包括双歧杆菌、三联活菌胶囊、双歧杆菌四联活菌片以及美常安、整肠生等制剂，可以酌情进行选择。肠炎可以是慢性结肠炎、慢性直肠炎，也可以是小肠的慢性炎症，还可以是溃疡性结肠炎。无论何种类型的肠炎，均可以使用益生菌进行调理，均具有辅助治疗的效果，能起到一定的疗效。
益生菌能够治疗肠炎，但不是所有的肠炎单凭益生菌能够治好。例如溃疡性结肠炎与自身免疫相关，轻症需要使用柳氮磺吡啶类的药物，例如氨基水杨酸制剂等；重症可能需要应用糖皮质激素，甚至免疫抑制剂进行治疗。益生菌在不同的情况下，均能够对肠炎具有辅助治疗作用。不同的类型的肠炎，医生还会加用其他的药物治疗，遵医嘱服药即可。
