到目前为止已经认可，幽门螺杆菌是感染性疾病，并且这种感染可以传播，但是具体的传播途径并不完全清楚，主要通过流行病学方面的证据，认为幽门螺杆菌只定植在人的胃黏膜，在动物的胃黏膜里面也可以检出类似幽门螺杆菌的细菌，但证实它并不是幽门螺杆菌。从外界环境包括水源等也检测出幽门螺杆菌，是用分子生物学的检测，其实并不是细菌培养的方法，所以这些结果分析起来认为，幽门螺杆菌其实只定植在人的胃黏膜，唯一的感染源是人。所以幽门螺杆菌是人和人之间互相传播。

幽门螺杆菌在人的唾液、牙菌斑、病人呕吐物等中都可以检测或培养出幽门螺杆菌，从粪便里面也可以检测出幽门螺杆菌，所以推测幽门螺杆菌的传播途径是通过口口途径或粪口途径进行传播。如中国人很喜欢用筷子，共同聚餐，增加了幽门螺杆菌感染的风险。比较偏僻的地区，目前对婴儿的喂养仍然是大人咀嚼食物，然后再给孩子吃，这样也会增加幽门螺杆菌感染的风险。另外，不好的卫生习惯，如饭前、便后不洗手，因为大便里面含有细菌，所以这时也会增加感染的风险。