直肠超声在肛肠外科，应用的范围还是相对比较广泛，在检查一些疾病时，往往需要直肠超声来初步判断。做这项检查前需要一定的准备工作，最主要的是需要在一定程度上将直肠、肛管这一段清理干净，主要是采取灌肠或者喝泻药来进行肠道准备。
在做超声检查时，会在超声探头上涂抹导图的介质，一种像凝胶的药物，在肛门处会涂抹局部浸润麻醉的药物，可以最大程度地减轻肛门的疼痛不适感。在做超声时，探头需要插入肛管内观察疾病部位的病情变化，通过探头可以传导出腔内的具体声像。
直肠肿瘤可以通过直肠超声来判断肿瘤目前的分期，可以看肿瘤目前对周围组织的侵袭程度。另外，直肠炎症、肛管脓肿或者肛瘘等疾病，通过直肠超声都可以初步判断。
