肠溶避孕药和普通避孕药，最大的区别就是两种药物的剂型不同。肠溶性药物和一般性药物最重要的区别，在于肠溶性的避孕药有一层不在胃内融化的保护层，因此称是肠溶剂型。这种药物通过口服进入胃肠道后，不会在胃内崩解吸收，而在肠道内吸收，可以最大程度缓解或者减轻药物引起的胃肠道不适。另外，在肠内可以达到缓释，可以起到有效充分利用药理功效的作用。

肠溶避孕药和普通避孕药，实际的药理成分相同，主要的药理作用都是起到避孕的作用。其中最重要的药理成分是高浓度的雌激素和孕激素，通过改变卵巢的排卵功能，改变宫颈黏液，抑制受精卵的着床来达到避孕的目的。由于药理成分一样，所以药物特性也一样，只是剂型不同。

普通避孕药可以在胃内崩解，也可以在胃内吸收和肠内吸收，肠溶性避孕药可以避免在胃内融化，而直接在肠道内吸收，主要是防止胃酸影响药物的药理特性，同时还会减轻胃肠道的反应。另外，在肠道内吸收可以最大程度地发挥药理功效。所以肠溶避孕药和普通避孕药的区别就是剂型不同，吸收的部位有所差别。