长智齿疼痛的原因包括智齿周围发生了炎症及智齿顶伤邻牙引起疼痛。由于智齿与邻牙的位置关系，食物残渣易嵌塞于邻牙跟智齿之间，食物残渣长期嵌塞导致腐烂，使智齿和邻牙龋坏引起疼痛。部分疼痛是由于智齿顶伤邻牙，损伤神经引起神经性疼痛，建议患者智齿拔除术后邻牙进行根管治疗，以解决疼痛症状。