临床上牙本质过敏症可以根据病因选择治疗方式，比如患者有不良饮食习惯，特别喜欢咀嚼硬物，不良的生活习惯，喜欢咬筷子、咬笔，造成磨耗、磨损出现牙本质过敏，要提醒患者更改不好的生活习惯。如果患者特别喜欢吃酸性食物造成牙釉质脱矿、牙本质过敏，要提醒患者改变饮食习惯，改变摄食频率和摄食方式，最好在进食酸性食物以后漱口。龋病造成牙本质过敏就要进行龋病治疗，牙齿楔状缺损造成牙本质过敏，除了要对楔状缺损进行充填治疗以外，还要对患者进行口腔卫生宣教，告诉他什么才是正确的刷牙方法。
临床上还可以根据患者的疼痛程度选择治疗方式，没有明显感觉可以不做处理。患者只是轻微不舒服，可以建议回家以后使用脱敏牙膏、脱敏糊剂日常护理牙齿。如果患者出现比较严重的疼痛，可以在诊室里使用高浓度脱敏药物对患牙进行处理，现在有一项新的技术就是使用激光进行脱敏治疗。患者出现非常严重的疼痛，只有使用有创侵入性治疗，比如给患牙做根管治疗，就是平时老百姓所说的钻牙齿抽神经的治疗方法，从而达到缓解患牙疼痛的目的。
