药流后有残留的概率较高，大概为10%。如果残留较大，不清宫可能会导致突发性大出血，通常多于月经出血。由于长时间的持续出血，可能发生继发感染，从而影响以后的妊娠，包括不孕或宫腔内膜损伤。通常在药流以后的2周左右，无论有无出血和腹痛的症状，均应该进行B超，明确宫腔内有无残留。
如果宫内仍有残留，并且残留物较小，可以口服药物，使组织排出，具有一定的辅助作用。但是如果残存物较多，也可以通过清宫手术，解决此问题。如果在药流以后出现多余月经的出血、腹痛或发热等表现，应该及时到医院就诊，以确定宫腔有无异常问题，是否需要进行紧急的手术处理。
