反流性食管炎的治疗分两个方面。对于无合并症的反流性食管炎一般采用内科治疗，即使用药物针对胃酸、十二指肠液、胆汁等物质的反流和贲门括约肌松弛、廓清功能的下降等因素进行治疗；对于引起合并症的重度反流性食管炎的治疗，除了用药以外还可以进行外科手术治疗。