扁桃体结石的名称不是特别准确，不能称为扁桃体结石。它是指扁桃体隐窝发炎时的分泌物，并不是每个人都有，只有慢性扁桃体炎，尤其是隐窝型扁桃体炎的患者才会有。
扁桃体是长在咽部，也是两个淋巴组织，它的表面会有十几个隐窝陷到扁桃体实质，有些隐窝口通到咽部。扁桃体隐窝会有分泌物，尤其隐窝型慢性扁桃体炎的主要炎症病变就是在隐窝。扁桃体上级有扁桃体的上隐窝，常常会出现较多黄白色的分泌物，有时病人用力咳会咳出臭味物质，部分病人称为扁桃体结石，其实为隐窝发炎的分泌物，加之部分食物残渣堵在隐窝口。扁桃体发炎时，慢性炎症越厉害分泌物会越多。
