感染性结膜炎，通常可以针对病因使用抗生素眼药水，包括细菌、病毒、真菌感染等，其它药物也可以缓解症状，常见药物如下：
1、抗生素滴眼液：包括红霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液、夫西地酸滴眼液等；
2、抗病毒滴眼液：通常可以使用更昔洛韦眼用凝胶；
3、抗真菌滴眼液：可以使用那他霉素滴眼液、酮康唑滴眼液等抗真菌药物。
如果出现感染性结膜炎，同时还可能会使用某些共性药物，例如普拉洛芬眼药水、色甘酸钠眼药水等，可以缓解眼表疼痛，减轻眼表组织水肿。另外患者还可以使用眼表修复剂，包括重组牛碱性成纤维细胞生长因子滴眼液、表皮细胞生长因子滴眼液等，可以缓解眼表不适、干眼或异物感等不适症状，同时部分患者由于干眼会使用人工泪液，如玻璃酸钠滴眼液等。此外感染性结膜炎患者需要注意，在每天晚上睡觉前进行眼膏涂抹，可以维持眼表药物的有效程度。
