眼睛红、眼屎多能否自愈取决于感染病的原体情况，眼睛红眼屎多通常代表眼睛出现炎症，如果仅为病毒引起的炎症，通常2周左右即可好转，但部分病毒可能迁延不愈，或病毒感染同时合并细菌感染。
此时如果不使用抗生素眼药水可能较难自愈，严重情况时甚至可引起角膜穿孔，若出现眼睛红、眼屎多的情况，建议及时到眼科就诊。可能给予抗生素、抗病毒的眼药水进行治疗，以缓解症状，减轻患者的不适感，同时缩短症状的存在时间，使局部症状尽快好转，同时也可以预防并发症出现。
部分患者病毒感染1周左右时，可能眼睛红、眼屎多的症状会消失。但病毒可能侵犯角膜，在角膜上形成浸润斑，后期可能发展为斑翳，甚至永久性存在不能消除。
