后脑勺部位的疼痛特别是骨头疼痛，这时很难直接定位到骨头，明确是否为骨头疼痛，也可能是骨头继发病变导致，如中耳炎、乳突炎继发后的枕骨的骨髓炎。也可以是颅骨的转移瘤，如肺癌、前列腺癌、乳腺癌等枕骨转移，或者颅骨骨髓瘤等原发性颅骨肿瘤，除此之外，颅骨嗜酸性肉芽肿也会引起颅骨局部疼痛。
对于后脑勺的部位定位不太明确的疼痛，还需要考虑是否发生颅内病变，如后颅窝脑膜瘤占位效应可以使患者出现后枕部疼痛。颅内恶性肿瘤如髓母细胞瘤、小脑转移瘤等，也可以使患者出现相应的症状。还有先天性疾患如先天性小脑扁桃体下疝畸形，由于造成脑脊液循环梗阻，患者也可以表现为后脑部疼痛，在咳嗽、打喷嚏时疼痛加重。
所以对于后脑部疼痛，如果定位不明确时需要进一步进行检查，包括头颅CT的骨窗像检查，以及头颅的增强核磁检查，明确引起患者局部疼痛的具体原因，到底是来源于颅骨，还是来源于颅内，到底是良性病变引起，还是恶性病变引起。
