对于牙周、牙髓联合病变患者，要尽量找出原发病变，彻底消除感染原，同时要积极治疗牙周、牙髓两个方面病变。对于由牙髓根尖病变引起牙周病变患牙，先应该尽早行根管治疗，病程短者根管治疗后，牙周病损很快就会痊愈。
对于病程长者，则应在根管治疗开始后同时或尽快开始常规牙周治疗，促进组织愈合，患牙预后相对不错。但是对于患牙已有深牙周袋，但牙髓活力降低或者死髓牙情况，一定要先行根管治疗及牙周治疗，而对于牙髓活力尚好牙齿，可以先行牙周治疗。如果疗效不太好，再视情况确定是否进行牙髓的治疗。
患牙主要病因是牙槽骨吸收或者附着丧失，已经接近根尖，大部分情况牙齿治疗效果不太好，预后比较差，最终可能需要拔除。同时对于过于松动、感染已经不能控制的患者，也应尽早拔除、消除病灶。
