甲状腺穿刺以后的良恶性结果由病理科医生通过显微镜下观察，然后作出肿物性质的判断。穿刺活检是用穿刺针在超声的引导下放到肿物附近，激发开关，取出肿瘤组织，作病理判断。如果穿刺的损伤较小，患者不会有过多痛苦，但是可能会造成假阴性的结果，即没有明确穿导病变部位，导致良性诊断，耽误了恶性诊断。因此对于甲状腺的肿物性质，除穿刺活检外，定期观察以及必要的手术切除是明确肿物性质的最终方法。
在甲状腺疾病的诊断中，超声是最常用的影像学检查方法，可以根据肿物的大小、边缘是否光滑、肿物内是否有血运、钙化以及肿物的生长纵横比，对肿物的性质作出初步判断。如果为4级及以上的肿物，有一定的恶性可能，即便是较小的4级以上肿物，也建议患者进行穿刺活检或手术切除，对肿物性质作出判断。
