甲状腺手术是位置相对表浅的手术，但不是小手术。因为甲状腺周围有相对比较重要的神经、血管，以及内分泌器官甲状旁腺。所以在甲状腺手术中，要求较为仔细的操作，在处理甲状腺上级的时候，一定要避免损伤喉上神经。喉上神经损伤以后，患者可能会出现饮水呛咳。
在处理甲状腺下级的时候，尤其是喉返神经入喉的地方，要避免损伤喉返神经。如果损伤喉返神经，患者术后可能会出现声音的嘶哑。两侧喉返神经损伤，患者可能就会出现窒息。
另外，甲状腺背侧有2-4个甲状旁腺，主要调节人体钙磷代谢。如果在做甲状腺全切的时候损伤或误切甲状旁腺，患者可能会出现术后低钙、抽搐，患者会非常痛苦。如果甲状腺手术损伤了血管，会出现术后的血肿，甚至引起窒息。
