尿液呈褐色一般多不考虑食物和药物的影响，因为食物和药物的引起来的尿色改变通常色淡，而褐色的尿液首先考虑是存在有血尿。
血尿的时候可以看到镜下有大量红细胞的存在，血尿发生了以后，应当对血尿发生的原因进行追查。血尿发生的原因非常复杂，有泌尿系统问题。泌尿系统如果出问题，内科性的问题通常见于急慢性肾小球肾炎、间质性肾炎和IgA肾病。
外科性的问题主要见于泌尿系统的炎症、结石、结核、肿瘤、畸形、损伤以及血管问题，几乎涵盖绝大多数的泌尿外科疾病。其他可以引起血尿的疾病还包括心脏病、血液病、自身免疫病、严重的感染、男女生殖系统问题，还有药物性的血尿以及运动性血尿。
另外一种可能就是出现血红蛋白尿或者肌红蛋白尿，尿液中出现血红蛋白或者肌红蛋白的时候，尿液可以表现为浓茶色、红葡萄酒色或者酱油色。血红蛋白尿主要是见于各种严重的血管内溶血，比如溶血性贫血、血型不合输血以及阵发性睡眠性血红蛋白尿症。
肌红蛋白尿主要见于挤压综合征，以及缺血性肌坏死，有的时候剧烈运动也会造成肌红蛋白尿的发生。
所以对于褐色的尿，通常要结合伴随症状以及辅助检查来明确诊断，然后对因进行治疗。
