指甲内陷通常和营养不良、感染、损伤等因素相关，不同的原因处理的方法也有较大差别。比较多见的是外伤造成的甲床损伤，在愈合时初步形成的指甲会形成畸形生长，进而导致指甲内陷，在这种情况下，只要甲床功能正常，随着逐步的愈合，伤口完整的恢复，指甲大多可以恢复正常生长。如果是由感染造成，比如真菌感染，可能会造成甲板增厚，比较多见的是灰指甲，这种内陷只有经过积极地治疗，控制感染，才能恢复指甲的正常生长。
有时候指甲的畸形生长和营养不良相关，尤其是局部的血供障碍，而发生这种情况通常是和基础疾病相关，比如患者有糖尿病，很容易造成末梢的血液循环不良，这样给指甲的生长造成一定的障碍，尤其是足部的趾甲更容易出现营养不良，而生长畸形。在这种情况下，应积极地治疗原发疾病，并且通过体育运动或适当地服用药物，加快末梢血液循环，改善指甲的营养，相应的指甲内陷现象也会一定程度的缓解。
