目前针对甲状腺功能亢进症治疗有三种方法，包括手术、碘-131、咪唑类或者硫唑类药物，所以现在甲状腺治疗还是这几大类药物。一般见甲状腺较大或者考虑高功能腺瘤才考虑手术，但是手术治疗的前提是一定要把甲状腺控制的较好，然后才能做手术。另外就是放射性碘治疗，放射性碘治疗毕竟是放射线，一般用在高功能腺瘤上，对哺乳、妊娠不是特别推荐，毕竟有射线。
其它的会用到丙硫氧嘧啶或者甲巯咪唑类的药物，其机制主要是抑制体内的甲状腺素合成，但是体内已经合成的甲状腺素，要历时1个月才能代谢完。所以给予抗甲状腺的药物很多病人的症状改善要在3-4周以后才能看到明显改变。在甲状腺药物没有起效，或者体内已经存在的甲状腺素没有代谢完时，病人的症状较明显，这时会用β阻滞剂，让病人基础代谢率下降，先舒服然后等抗甲状腺素药物起效以后，病人的症状就会逐渐改善。
