脊柱结核的治疗疗程根据每个患者的情况而有所不同，包括感染脊柱的节段、病变的严重程度，患者有没有出现截瘫、大的流注脓肿等情况。一般来说，脊柱结核药物治疗和手术治疗大概疗程要一年以上。若骨质破坏轻，没有截瘫、流注脓肿等手术指征，可以保守治疗的患者，一般的药物保守治疗需要一年以上。
如果合并其它部位结核，需要治疗一年半以上。有耐药基础的结核患者，药物保守治疗要两年或者两年半以上才能达到治愈。如果患者需要手术，治愈的时间需要综合评价手术效果，手术后一般需要抗结核治疗，使血沉降到正常，局部跖骨融合会比较稳定，大概需要一年以上。
