如果仅从手术的操作或者对机体的损伤，射频消融术是微创手术，不算大手术。但是如果从技术难度和手术难度，射频消融术是大手术。
因为尤其是对于儿童的射频消融术，由于心腔小、血管细，所以操作比较困难。其次，现在临床用的射频消融术的器材基本上都是成人的，没有儿童特制的消融术器材，所以相对操作难度更大。
因此目前儿童的射频消融术仅局限在上海、北京、广州等几个儿童医学中心开展，对于熟练的术者，其可能的并发症比较少。但是如果技术不熟练，可能会导致血管并发症，比如动静脉瘘、血栓或者心脏并发症，比如心肌穿孔、房室传导阻滞等。
随着现在射频消融术器械的提高以及技术的提高，这些并发症越来越少。但是射频消融术，技术含量依旧非常高。所以在做这种手术时，要慎重的选择医院和医生。
