一般进行胃镜检查应挂消化内科，因为消化内科医生通过对患者症状的咨询和体格检查后，能较准确地判断是否存在胃部疾病。

在体检科或其它科室，患者亦可以遵循医嘱进行胃镜检查。如体检时发现幽门螺杆菌感染，且患者年龄较大，患者咨询体检科的医生后，可转到消化内科就诊。消化内科医生会根据患者的情况进行判断，是否需做胃镜检查。