乙肝抗病毒的药物大概分为两类，一个是直接的抗病毒药物，包括核苷(酸)类似物与核苷类似物，目前一线的药物有恩替卡韦和替诺福韦。还有一个是干扰素，副作用相比前者较大。这些药物或多或少会有一些副作用，具体如下：
一、直接的抗病毒药物副作用：
1、肌肉损伤：比如骨骼肌的受损，患者可以出现肌酶的上升、CK的上升、乳酸脱氢酶的升高；
2、其他：部分患者可出现潜在肾损伤，或者早期可以出现蛋白尿，部分患者可以出现肾小管损伤的症状，出现糖尿、氨基酸尿，有时生化检查可以出现钙和磷比值的失调。
二、干扰素类药物副作用：
1、发热：干扰素常见的不良反应或副作用，先是会出现发热，常在打干扰素的前三针患者出现高热，体温达到38℃，甚至39℃以上；
2、血液系统问题：患者可以出现白细胞下降、血小板减少；
3、甲状腺受损：出现甲亢或甲减；
4、其他：可诱发自身免疫病，较严重时会诱发红斑狼疮。
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