CT和磁共振的工作原理不同，导致CT有辐射，而磁共振没有辐射。磁共振是通过人体内氢原子核在高强磁场中激发与还原，然后收集信息重建图像，而CT是通过X线辐射穿透人体产生的效应来重建人体图像，故磁共振所指的核为人体内氢原子核，而非辐射核，CT是利用X线，所以有辐射。

虽然磁共振无辐射，但因其和CT检查不同，故有些情况下无法相互替代。如果检查肺结节，则不能选择磁共振，此时必须要用CT。因此，对于临床检查而言，医生会根据具体情况来选择可靠的检查方式。