腰部针灸若在正常情况下，即未在月经期间进行，通常对于月经周期改变较不明显。若部分患者较为敏感，即身体对于外界刺激反应较敏感，可能出现月经周期改变，例如月经提前或错后。若出现上述情况，停止针灸后便可自行调整，即针灸引起内分泌改变，经过一段时间调整，月经周期便可逐渐恢复正常。
通常在月经期间，小腹部、腰骶部不主张针灸。因为在月经期间由于盆腔充血，在小腹部或腰骶部进行针刺，若刺激量较大，便可能加重盆腔充血，造成月经淋漓不尽或月经量增大等情况发生，从而影响月经周期。若在平时针灸腰骶部或小腹部，部分患者月经周期受影响，通常也无需担心，待停针一段时间后月经周期便可逐渐自行恢复。
